博茨瓦纳大部分地区属热带草原气候，西部为沙漠、半沙漠气候。年平均气温21°C。一年分旱、雨两季，雨季炎热，旱季干冷，昼夜温差大。10月至次年4月为雨季（湿热季），5月至9月为旱季（干冷季）。1月最热，白天平均气温33°C，最高可达43°C，夜间平均气温18°C。7月最冷，平均最高气温22°C，最低5°C，夜间最低可到0°C以下。 　　年平均降雨量457毫米，大部分地区干旱少雨。北部地区年均降雨量650—700毫米，南部和东南部地区年均降雨量400—500毫米，西部和西南部地区年均降雨量仅250毫米。降雨主要集中在雨季，旱季降雨量仅占全年的1%到10%，1、2两月为降雨最多的月份。